Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SS18Q15532 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms