Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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