Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms