Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
SMC1AQ14683 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMC1AQ14683 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMC1AQ14683 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMC1AQ14683 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMC1AQ14683 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMC1AQ14683 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMC1AQ14683 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMC1AQ14683 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMC1AQ14683 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMC1AQ14683 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMC1AQ14683 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMC1AQ14683 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMC1AQ14683 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMC1AQ14683 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMC1AQ14683 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMC1AQ14683 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMC1AQ14683 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMC1AQ14683 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMC1AQ14683 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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