Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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