Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PRPF4BQ13523 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms