Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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