Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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