Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms