Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERVV-1B6SEH8 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms