Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r25W4VSP2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms