Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.9 ms