Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nup160Q9Z0W3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup160Q9Z0W3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms