Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms