Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Gpc6Q9R087 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc6Q9R087 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc6Q9R087 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Gpc6Q9R087 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc6Q9R087 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc6Q9R087 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc6Q9R087 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc6Q9R087 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc6Q9R087 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc6Q9R087 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc6Q9R087 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc6Q9R087 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gpc6Q9R087 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc6Q9R087 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc6Q9R087 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc6Q9R087 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gpc6Q9R087 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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