Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ03

Slc39a1, Zinc transporter ZIP1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a1Q9QZ03 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc39a1Q9QZ03 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc39a1Q9QZ03 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc39a1Q9QZ03 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc39a1Q9QZ03 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc39a1Q9QZ03 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc39a1Q9QZ03 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc39a1Q9QZ03 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc39a1Q9QZ03 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc39a1Q9QZ03 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc39a1Q9QZ03 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc39a1Q9QZ03 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc39a1Q9QZ03 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms