Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nufip1Q9QXX8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms