Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms