Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms