Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms