Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Tuba8Q9JJZ2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Tuba8Q9JJZ2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Tuba8Q9JJZ2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Tuba8Q9JJZ2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Tuba8Q9JJZ2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Tuba8Q9JJZ2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tuba8Q9JJZ2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tuba8Q9JJZ2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tuba8Q9JJZ2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tuba8Q9JJZ2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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