Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ClpxQ9JHS4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms