Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms