Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB85

Rrp8, Ribosomal RNA-processing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp8Q9DB85 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rrp8Q9DB85 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rrp8Q9DB85 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rrp8Q9DB85 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rrp8Q9DB85 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rrp8Q9DB85 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rrp8Q9DB85 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rrp8Q9DB85 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rrp8Q9DB85 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rrp8Q9DB85 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rrp8Q9DB85 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp8Q9DB85 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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