Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAQ7

3110070M22Rik, RIKEN cDNA 3110070M22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110070M22RikQ9DAQ7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
3110070M22RikQ9DAQ7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
3110070M22RikQ9DAQ7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
3110070M22RikQ9DAQ7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
3110070M22RikQ9DAQ7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
3110070M22RikQ9DAQ7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
3110070M22RikQ9DAQ7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
3110070M22RikQ9DAQ7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
3110070M22RikQ9DAQ7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
3110070M22RikQ9DAQ7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms