Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms