Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms