Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PudpQ9D5U5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms