Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc83Q9D4V3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms