Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc47Q9D024 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc47Q9D024 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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