Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pin4Q9CWW6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms