Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Smurf1Q9CUN6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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