Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd1Q9CR42 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ankrd1Q9CR42 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ankrd1Q9CR42 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ankrd1Q9CR42 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ankrd1Q9CR42 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ankrd1Q9CR42 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd1Q9CR42 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd1Q9CR42 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd1Q9CR42 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd1Q9CR42 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd1Q9CR42 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd1Q9CR42 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd1Q9CR42 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms