Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4931417E11RikQ9CR05 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms