Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Use1Q9CQ56 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Use1Q9CQ56 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Use1Q9CQ56 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Use1Q9CQ56 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Use1Q9CQ56 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Use1Q9CQ56 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Use1Q9CQ56 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Use1Q9CQ56 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Use1Q9CQ56 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Use1Q9CQ56 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Use1Q9CQ56 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Use1Q9CQ56 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Use1Q9CQ56 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Use1Q9CQ56 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Use1Q9CQ56 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Use1Q9CQ56 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Use1Q9CQ56 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Use1Q9CQ56 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Use1Q9CQ56 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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