Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms