Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cstf3Q99LI7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms