Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms