Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG5

Lsr, Lipolysis-stimulated lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsrQ99KG5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LsrQ99KG5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LsrQ99KG5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LsrQ99KG5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LsrQ99KG5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LsrQ99KG5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LsrQ99KG5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LsrQ99KG5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LsrQ99KG5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LsrQ99KG5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LsrQ99KG5 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LsrQ99KG5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LsrQ99KG5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LsrQ99KG5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LsrQ99KG5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsrQ99KG5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms