Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlcd1Q99JT6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms