Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Spef1Q99JL1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Spef1Q99JL1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Spef1Q99JL1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Spef1Q99JL1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Spef1Q99JL1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Spef1Q99JL1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Spef1Q99JL1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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