Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcdhga12Q91XY7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms