Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mark1Q8VHJ5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mark1Q8VHJ5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 915 ms