Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BbxQ8VBW5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms