Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms