Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Rab11fip3Q8CHD8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Rab11fip3Q8CHD8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Rab11fip3Q8CHD8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Rab11fip3Q8CHD8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Rab11fip3Q8CHD8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Rab11fip3Q8CHD8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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