Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ercc8Q8CFD5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ercc8Q8CFD5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ercc8Q8CFD5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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