Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZ97

Prdm8, PR domain zinc finger protein 8, mousemouse

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Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm8Q8BZ97 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prdm8Q8BZ97 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prdm8Q8BZ97 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Prdm8Q8BZ97 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Prdm8Q8BZ97 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Prdm8Q8BZ97 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Prdm8Q8BZ97 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Prdm8Q8BZ97 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Prdm8Q8BZ97 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Prdm8Q8BZ97 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm8Q8BZ97 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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