Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms