Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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H2-M10.4Q85ZW8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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H2-M10.4Q85ZW8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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H2-M10.4Q85ZW8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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H2-M10.4Q85ZW8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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H2-M10.4Q85ZW8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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H2-M10.4Q85ZW8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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H2-M10.4Q85ZW8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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